If you made any changes in Pure these will be visible here soon.

Research Output

  • 146 Article
  • 2 Conference Abstract/Poster in journal
  • 1 Comment/Letter to the editor
Filter
Article

A Privacy-Preserving Infrastructure for Analyzing Personal Health Data in a Vertically Partitioned Scenario

Sun, C., Ippel, L., van Soest, J., Wouters, B., Malic, A., Adekunle, O., van den Berg, B., Mussmann, O., Koster, A., van der Kallen, C., van Oppen, C., Townend, D., Dekker, A. & Dumontier, M., 21 Aug 2019, In : Studies in Health Technology and Informatics. 264, p. 373-377 5 p.

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

Open Access

Association of dietary folate and vitamin B-12 intake with genome-wide DNA methylation in blood: a large-scale epigenome-wide association analysis in 5841 individuals

Mandaviya, P. R., Joehanes, R., Brody, J., Castillo-Fernandez, J. E., Dekkers, K. F., Do, A. N., Graff, M., Hänninen, I. K., Tanaka, T., de Jonge, E. A. L., Kiefte-de Jong, J. C., Absher, D. M., Aslibekyan, S., de Rijke, Y. B., Fornage, M., Hernandez, D. G., Hurme, M. A., Ikram, M. A., Jacques, P. F., Justice, A. E. & 28 others, Kiel, D. P., Lemaitre, R. N., Mendelson, M. M., Mikkilä, V., Moore, A. Z., Pallister, T., Raitakari, O. T., Schalkwijk, C. G., Sha, J., Slagboom, E. P. E., Smith, C. E., Stehouwer, C. D. A., Tsai, P-C., Uitterlinden, A. G., van der Kallen, C. J. H., van Heemst, D., Arnett, D. K., Bandinelli, S., Bell, J. T., Heijmans, B. T., Lehtimäki, T., Levy, D., North, K. E., Sotoodehnia, N., van Greevenbroek, M. M. J., van Meurs, J. B. J., Heil, S. G. & BIOS Consortium, CHARGE Consortium Epigenetics Working Group, CHARGE Consortium Nutrition Working Group, Aug 2019, In : American Journal of Clinical Nutrition. 110, 2, p. 437-450 14 p., 15.

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

Open Access

Epigenome-wide Association Study of Attention-Deficit/Hyperactivity Disorder Symptoms in Adults

van Dongen, J., Zilhao, N. R., Sugden, K., Hannon, E. J., Mill, J., Caspi, A., Agnew-Blais, J., Arseneault, L., Corcoran, D. L., Moffitt, T. E., Poulton, R., Franke, B., Boomsma, D., Heijmans, B. T., t'Hoen, P. A. G., van Meurs, J., Isaacs, A., Jansen, R., Franke, L., Pool, R. & 31 others, Hottenga, J. J., van Greevenbroek, M. M. J., Stehouwer, C. D. A., van der Kallen, C. J. H., Schalkwijk, C. G., Wijmenga, C., Zhernakova, S., Tigchelaar, E. F., Slagboom, P. E., Beekman, M., Deelen, J., van Heemst, D., Veldink, J. H., van den Berg, L. H., van Duijn, C. M., Hofman, B. A., Uitterlinden, A. G., Jhamai, P. M., Verbiest, M., Suchiman, H. E. D., Verkerk, M., van der Breggen, R., van Rooij, J., Lakenberg, N., Mei, H., van Iterson, M., van Galen, M., Bot, J., Zhernakova, D., van t'Hof, P. & BIOS Consortium, 15 Oct 2019, In : Biological Psychiatry. 86, 8, p. 599-607 9 p.

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

Open Access

Large-scale plasma metabolome analysis reveals alterations in HDL metabolism in migraine

Onderwater, G. L. J., Ligthart, L., Bot, M., Demirkan, A., Fu, J., van der Kallen, C. J. H., Vijfhuizen, L. S., Pool, R., Liu, J., Vanmolkot, F. H. M., Beekman, M., Wen, K., Amin, N., Thesing, C. S., Pijpers, J. A., Kies, D. A., Zielman, R., de Boer, I., van Greevenbroek, M. M. J., Arts, I. C. W. & 17 others, Milaneschi, Y., Schram, M. T., Dagnelie, P. C., Franke, L., Ikram, M. A., Ferrari, M. D., Goeman, J. J., Slagboom, P. E., Wijmenga, C., Stehouwer, C. D. A., Boomsma, D. I., van Duijn, C. M., Penninx, B. W., 't Hoen, P. A. C., Terwindt, G. M., van den Maagdenberg, A. M. J. M. & BBMRI Metabolomics Consortium, 16 Apr 2019, In : Neurology. 92, 16, p. E1899-E1911 13 p.

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

Open Access

Mendelian randomization integrating GWAS and eQTL data reveals genetic determinants of complex and clinical traits

Porcu, E., Rueger, S., Lepik, K., Agbessi, M., Ahsan, H., Alves, I., Andiappan, A., Arindrarto, W., Awadalla, P., Battle, A., Beutner, F., Bonder, M. J., Boomsma, D., Christiansen, M., Claringbould, A., Deelen, P., Esko, T., Fave, M-J., Franke, L., Frayling, T. & 32 others, Gharib, S. A., Gibson, G., Heijmans, B. T., Hemani, G., Jansen, R., Kahonen, M., Kalnapenkis, A., Kasela, S., Kettunen, J., Kim, Y., Kirsten, H., Kovacs, P., Krohn, K., Kronberg-Guzman, J., Kukushkina, V., Lee, B., Lehtimaki, T., Loeffler, M., Marigorta, U. M., Mei, H., Milani, L., Montgomery, G. W., Mueler-Nurasyid, M., Nauck, M., Stehouwer, C. D. A., Isaacs, A., Schalkwijk, C. G., Stehouwer, C. D. A., van der Kallen, C. J. H., van Greevenbroek, M. M. J., eQTLGen Consortium & BIOS Consortium, 24 Jul 2019, In : Nature Communications. 10, 12 p., 3300.

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

Open Access

Occupational exposure to gases/fumes and mineral dust affect DNA methylation levels of genes regulating expression

van Der Plaat, D., Vonk, J. M., Terzikhan, N., de Jong, K., de Vries, M., La Bastide-van Gemert, S., van Diemen, C. C., Lahousse, L., Brusselle, G., Nedeljkovic, I., Amin, N., Kromhout, H., Vermeulen, R. C. H., Postma, D. S., van Duijn, C. M., Boezen, H. M., Heijmans, B. T., Hoen, P. A. C. T., van Meurs, J., Isaacs, A. & 31 others, Jansen, R., Franke, L., Boomsma, D., Pool, R., van Dongen, J., Hottenga, J. J., van Greevenbroek, M. M. J., Stehouwer, C. D. A., van Der Kallen, C. J. H., Schalkwijk, C. G., Wijmenga, C., Zhernakova, S., Tigchelaar, E. E., Slagboom, P. E., Beekman, M., Deelen, J., van Heemst, D., Veldink, J. H., van den Berg, L. H., Hofman, B. A., Uitterlinden, A. G., Jhamai, P. M., Verbiest, M., Suchiman, H. E. D., Verkerk, M., van Der Breggen, R., van Rooij, J., Lakenberg, N., Mei, H., van Iterson, M. & BIOS Consortium, 1 Aug 2019, In : Human Molecular Genetics. 28, 15, p. 2477-2485 9 p.

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

Open Access

Sex differences in cardiovascular risk management for people with diabetes in primary care: a cross-sectional study

de Jong, M., Vos, R. C., de Ritter, R., van der Kallen, C. J., Sep, S. J., Woodward, M., Stehouwer, C. DA., Bots, M. L. & Peters, S. A., Jul 2019, In : BJGP Open. 3, 2, p. 1-11 bjgpopen19X101645.

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

Open Access

Skewed X-inactivation is common in the general female population

Shvetsova, E., Sofronova, A., Monajemi, R., Gagalova, K., Draisma, H. H. M., White, S. J., Santen, G. W. E., Lopes, S. M. C. D. S., Heijmans, B. T., van Meurs, J., Jansen, R., Franke, L., Kielbasa, S. M., den Dunnen, J. T., 't Hoen, P. A. C., Boomsma, D. I., Pool, R., van Dongen, J., Hottenga, J. J., Van Greevenbroek, M. M. J. & 32 others, Da Stehouwer, C., van der Kallen, C. J. H., Schalkwijk, C. G., Wijmenga, C., Zhernakova, S., Tigchelaar, E. F., Slagboom, P. E., Beekman, M., Deelen, J., van Heemst, D., Veldink, J. H., van den Berg, L. H., van Duijn, C. M., Hofman, B. A., Uitterlinden, A. G., Jhamai, P. M., Verbiest, M., Suchiman, H. E. D., Verkerk, M., van der Breggen, R., Isaacs, A., van Dijk, F., Li, M., Isaacs, A., Cox, D. R., Li, Y., Chen, R., Li, N., Wang, J., van Ommen, G. J., BIOS Consortium & GoNL Consortium, Mar 2019, In : European Journal of Human Genetics. 27, 3, p. 455-465 11 p.

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

Open Access

Subcutaneous Adipose Tissue and Systemic Inflammation Are Associated With Peripheral but Not Hepatic Insulin Resistance in Humans

van der Kolk, B. W., Kalafati, M., Adriaens, M., van Greevenbroek, M. M. J., Vogelzangs, N., Saris, W. H. M., Astrup, A., Valsesia, A., Langin, D., van der Kallen, C. J. H., Eussen, S. J. P. M., Schalkwijk, C. G., Stehouwer, C. D. A., Goossens, G. H., Arts, I. C. W., Jocken, J. W. E., Evelo, C. T. & Blaak, E. E., Dec 2019, In : Diabetes. 68, 12, p. 2247-2258 12 p.

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

Validated inference of smoking habits from blood with a finite DNA methylation marker set

Maas, S. C. E., Vidaki, A., Wilson, R., Teumer, A., Liu, F., van Meurs, J. B. J., Uitterlinden, A. G., Boomsma, D. I., de Geus, E. J. C., Willemsen, G., van Dongen, J., van der Kallen, C. J. H., Slagboom, P. E., Beekman, M., van Heemst, D., van den Berg, L. H., Duijts, L., Jaddoe, V. W. V., Ladwig, K-H., Kunze, S. & 9 others, Peters, A., Ikram, M. A., Grabe, H. J., Felix, J. F., Waldenberger, M., Franco, O. H., Ghanbari, M., Kayser, M. & BIOS Consortium, Nov 2019, In : European Journal of Epidemiology. 34, 11, p. 1055-1074 20 p.

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

Open Access

Analyzing Partitioned FAIR Health Data Responsibly

Sun, C., Ippel, L., Wouters, B., Soest, J. V., Malic, A., Adekunle, O., Berg, B. V. D., Puts, M., Mussmann, O., Koster, A., Kallen, C. V. D., Townend, D., Dekker, A. & Dumontier, M., 2 Dec 2018, In : arXiv . p. 1-6 6 p.

Research output: Contribution to journalArticleAcademic

A SNP panel for identification of DNA and RNA specimens

Yousefi, S., Abbassi-Daloii, T., Kraaijenbrink, T., Vermaat, M., Mei, H., van't Hof, P., van Iterson, M., Zhernakova, D. V., Claringbould, A., Franke, L., 't Hart, L. M., Slieker, R. C., van der Heijden, A., de Knijff, P., 't Hoen, P. A. C., BIOS Consortium, Jansen, R., van Meurs, J., Heijmans, B. T., Boomsma, D. I. & 45 others, van Dongen, J., Hottenga, J-J., Slagboom, P. E., Suchiman, H. E. D., van Iterson, M., van Zwet, E. W., 't Hoen, P., Pool, R., van Greevenbroek, M., Stehouwer, C., van der Kallen, C., Schalkwijk, C., Wijmenga, C., Zhernakova, A., Tigchelaar, E. F., Beekman, M., Deelen, J., van Heemst, D., Veldink, J. H., van den Berg, L. H., van Duijn, C. M., Hofman, B. A., Uitterlinden, A. G., Jhamai, P. M., Verbiest, M., Verkerk, M., van der Breggen, R., van Rooij, J., Lakenberg, N., Mei, H., Bot, J., Zhernakova, D. V., Van't Hof, P., Deelen, P., Nooren, I., Moed, M., Vermaat, M., Bonder, M. J., van Dijk, F., van Galen, M., Arindrarto, W., Kielbasa, S. M., Swertz, M. A., Isaacs, A. & Franke, L., 25 Jan 2018, In : BMC Genomics. 19, 90, 12 p., 90.

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

Open Access

Blood Metabolomic Measures Associate With Present and Future Glycemic Control in Type 2 Diabetes

't Hart, L. M., Vogelzangs, N., Mook-Kanamori, D. O., Brahimaj, A., Nano, J., van der Heijden, A. A. W. A., van Dijk, K. W., Slieker, R. C., Steyerberg, E. W., Ikram, M. A., Beekman, M., Boomsma, D. I., van Duijn, C. M., Slagboom, P. E., Stehouwer, C. D. A., Schalkwijk, C. G., Arts, I. C. W., Dekker, J. M., Dehghan, A., Muka, T. & 3 others, van der Kallen, C. J. H., Nijpels, G. & van Greevenbroek, M. M. J., Dec 2018, In : Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism. 103, 12, p. 4569-4579 11 p.

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

Blood pressure variability in individuals with and without (pre)diabetes: the Maastricht Study

Zhou, T. L., Reesink, K., Schram, M., Koster, A., Schaper, N., Dagnelie, P., van der Kallen, C., Sep, S., Stehouwer, C. & Henry, R., Feb 2018, In : Journal of Hypertension. 36, 2, p. 259-267 9 p.

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

Circulating Polyunsaturated Fatty Acids as Biomarkers for Dietary Intake across Subgroups: The CODAM and Hoorn Studies

Wanders, A. J., Alssema, M., De Hoon, S. E. M., Feskens, E. J. M., van Woudenbergh, G. J., van der Kallen, C. J., Zock, P. L., Refsum, H., Drevon, C. A., Elshorbagy, A., Schalkwijk, C. G., Stehouwer, C. D. A., Dekker, J. M. & van Greevenbroek, M. M. J., 1 Jan 2018, In : Annals of Nutrition and Metabolism. 72, 2, p. 117-125 9 p.

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

2017
Open Access

Disease variants alter transcription factor levels and methylation of their binding sites

Bonder, M. J., Luijk, R., Zhernakova, D. V., Moed, M., Deelen, P., Vermaat, M., van Iterson, M., van Dijk, F., van Galen, M., Bot, J., Slieker, R. C., Jhamai, P. M., Verbiest, M., Suchiman, H. E. D., Verkerk, M., van der Breggen, R., van Rooij, J., Lakenberg, N., Arindrarto, W., Kielbasa, S. M. & 31 others, Jonkers, I., van 't Hof, P., Nooren, I., Beekman, M., Deelen, J., van Heemst, D., Zhernakova, A., Tigchelaar, E. F., Swertz, M. A., Hofman, A., Uitterlinden, A. G., Pool, R., van Dongen, J., Hottenga, J. J., Stehouwer, C. D. A., van der Kallen, C. J. H., Schalkwijk, C. G., van den Berg, L. H., van Zwet, E. W., Mei, H., Li, Y., Lemire, M., Hudson, T. J., Slagboom, P. E., Wijmenga, C., Veldink, J. H., van Greevenbroek, M. M. J., van Duijn, C. M., Boomsma, D. I., Isaacs, A. & BIOS Consortium, Jan 2017, In : Nature Genetics. 49, 1, p. 131-138 8 p.

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

DNA Methylation Analysis Identifies Loci for Blood Pressure Regulation

Richard, M. A., Huan, T., Ligthart, S., Gondalia, R., Jhun, M. A., Brody, J. A., Irvin, M. R., Marioni, R., Shen, J., Tsai, P-C., Montasser, M. E., Jia, Y., Syme, C., Salfati, E. L., Boerwinkle, E., Guan, W., Mosley, T. H., Bressler, J., Morrison, A. C., Liu, C. & 31 others, Mendelson, M. M., Uitterlinden, A. G., van Meurs, J. B., Franco, O. H., Zhang, G., Li, Y., Stewart, J. D., Bis, J. C., Psaty, B. M., Chen, Y-D. I., Kardia, S. L. R., Zhao, W., Turner, S. T., Absher, D., Aslibekyan, S., Starr, J. M., Mcrae, A. F., Hou, L., Just, A. C., Schwartz, J. D., Vokonas, P. S., Menni, C., Spector, T. D., Shuldiner, A., Damcott, C. M., Rotter, J. I., BIOS Consortium, van Greevenbroek, M., Stehouwer, C., van der Kallen, C. & Schalkwijk, C., 7 Dec 2017, In : American Journal of Human Genetics. 101, 6, p. 888-902 15 p.

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review

Identification of context-dependent expression quantitative trait loci in whole blood

Zhernakova, D. V., Deelen, P., Vermaat, M., van Iterson, M., van Galen, M., Arindrarto, W., van 't Hof, P., Mei, H., van Dijk, F., Westra, H-J., Bonder, M. J., van Rooij, J., Verkerk, M., Jhamai, P. M., Moed, M., Kielbasa, S. M., Bot, J., Nooren, I., Pool, R., van Dongen, J. & 27 others, Hottenga, J. J., Stehouwer, C. D. A., van der Kallen, C. J. H., Schalkwijk, C. G., Zhernakova, A., Li, Y., Tigchelaar, E. F., de Klein, N., Beekman, M., Deelen, J., van Heemst, D., van den Berg, L. H., Hofman, A., Uitterlinden, A. G., van Greevenbroek, M. M. J., Veldink, J. H., Boomsma, D. I., van Duijn, C. M., Wijmenga, C., Slagboom, P. E., Swertz, M. A., Isaacs, A., van Meurs, J. B. J., Jansen, R., Heijmans, B. T., 't Hoen, P. A. C. & Franke, L., Jan 2017, In : Nature Genetics. 49, 1, p. 139-145 7 p.

Research output: Contribution to journalArticleAcademicpeer-review